“西南边疆项目”为国家社科基金特别委托项目，经过几年时间的准备，目前已经正式启动并开启了申报工作。2008年5月22日，云南省哲学社会规划办公室召集省内相关高校和省社科院科技处、科研处处长会议，落实西南边疆项目申报相关工作。

    云南省社会科学院于省社科规划办召集会议之后的第二天，即召开院学术委员会会议，对“西南边疆项目”申报工作进行传达动员，要求各研究所充分认识此项工作对于开展西南边疆历史与现实研究的重要意义，各单位应抓住这一机遇，在广泛申报的基础上，力争有较多的项目立项。经过动员，云南省社会科学院各研究所从不同学科不同专业方向设计项目积极进行申报，截至2008年6月27日，科研处共收到74份申报书。各申报人紧密结合申报指南，从历史、社会、文化、经济、生态及文献档案等不同的角度设计项目。6月24日下午，科研处召开专家会议，对申报书逐份进行讨论。各位专家从申报书的格式、内容、选题意义、可行性、研究队伍的组成等方面提出意见和建议。紧接着又召开全院申报人员会议，各申报单位人认真听取了专家的反馈意见。各申报者根据专家意见对申报书进行了修改。所有的申报书修改打印后，交到科研处，统一加盖社科院印章，与2008年6月28日前报送中国社科院科研局“西南边疆”办公室。