迪庆州藏学研究院又为云南省社科院迪庆分院，其前身是1983年成立的迪庆州《格萨尔》研究室(经报批云南省社科院成立，时任州长李玉芳兼任主任)，1993年成立迪庆州藏学研究所(使用“云南省社会科学院迪庆藏学研究所”的名称和印章，由省社科院和州民委共同领导)。2003年9月，经迪发〔2003〕21号文件批准升格组建迪庆州藏学研究院。2004年6月，迪庆藏族自治州藏学研究院、云南省社会科学院迪庆分院正式挂牌。迪庆州藏学研究院为处级文化科研事业单位，业务挂靠云南省社会科学院，内设办公室、综合研究室、藏文化基础研究科3个科室。2009年，迪庆州藏学研究院新增傈僳族文化研究室和东巴文化研究室2个科室。2011年，州藏学研究院行政隶属划归迪庆州委统战部，同年7月，州委批准成立迪庆州藏学研究院党组。现经调整院内五个科室更名为：办公室、科研规划发展研究室、藏文化研究科、傈僳族文化研究科、东巴文化研究科。迪庆州藏学研究院共有编制15人，现在职在编人员14人。包括管理人员4人，其中常务副院长1人(宗教人士)，正、副科级干部3人;事业人员8人，其中副研究员3人，助理研究员1人，研究实习员3人;工勤人员2人。