纳院长在讲话中阐述了改革的理论。他指出，从组织学理论的角度来看待改革问题，改革实质上就是要实现组织资源的合理有效的配置。根据组织学理论的观点，一个组织实体它所拥有的资源有三种配置方式：战略配置方式、权力配置方式和文化配置方式，从而形成组织资源的三大类型，即“战略资源”、“权力资源”和“文化资源”。“战略资源”或叫“资源的战略配置”，包括两类资源：一是目标资源，二是物质资源。对于一个组织来讲，合理的目标的选择具有重要的战略意义，是组织发展的带有根本性的资源。“物质资源”是实现组织目标的物质力量。从社科院看，目标资源总体是合理的，符合院的情况，也符合国家、省繁荣哲学社会科学的大趋势，问题在于院的总目标缺乏所、处级分目标强有力的支撑，或者说总目标在院、所和个人三个层面上的配置不均衡、不合理；从物质资源的量来看，社科院总体匮乏，从配置上看，服务战略重点不够，资源效益有待提高。从目标资源和物质资源的关系看，目标选择合理和配置科学，有利于争取更多的物质资源，物质资源配置合理则有利于战略目标的实现。促进我院战略资源的最大化是此次改革的重要原则。“权力资源”或者称分配和获取资源的权力的配置。权力作为一种资源体现在权力是获取资源和分配资源的力量和手段，权力越大获取资源和分配资源的能力就越强。追求权力的最大化是组织建设和实现组织目标的重要保障。对于权力最大化的理解有两种：一是趋向权力集中，这对于领导者和某些管理部门会增大权力，但不会产生权力资源总量的增值，相反，还可能造成权力资源的浪费；二是趋向于权力资源总量的增值，其途径就是放权、分权，调整权力结构，把权力变成组织内部各环节、各层次、各要素争取更多物质资源的手段。分权的同时也分配了责任和义务，有利于激活组织内部的积极性和创造性，从而会带来权力总量的增值。这也是这次改革所要遵循的原则。“文化资源”或称资源的文化配置。文化是组织系统内部的基本要素，是组织运行的润滑剂、生命力。文化资源是组织资源的核心资源，它包括组织成员的价值观念、心态特征和行为习惯等内容。文化资源的配置状况直接影响着战略资源、权力资源的配置，决定着组织目标的实现程度。因此，调整价值取向，端正心理状态、改变传统习惯是这次改革的重要内容。上述理论认识是我们设计这次改革方案的理论依据和理论支撑。

     纳院长接着阐述了这次科研管理体制改革的目标。他说，改革的目标就是建构起科学、合理地配置战略资源、权力资源和文化资源，既适应科研的“计划性”需要，又适应科研的“社会化”需要的科研管理的组织体系和科研管理的运行机制，为激活科研组织和科研人员积极性、自觉性，培育科研创新团队、增强科研创新能力、提高科研生产力提供体制和机制的保证。

    纳院长说，这次改革的内容主要围绕科研管理的“体”和“制”两方面展开。“体”就是科研管理的组织体系，“制”就是科研管理的运行保障机制。从“体”的角度看，这次改革要增加“科研工作室”这一组织层次，建构起“院、所（处）、科研工作室”三级科研管理组织体系，重新定位“院”、“所（处）”、“科研工作室”的责、权、利。从“制”的角度看，这次改革的主要内容是要建立起包括项目管理、经费管理、成果管理、人事人才管理、以及绩效奖励等在内的科研管理的运行保障机制。